Program Studi Teknologi Pangan Universitas Sultan Ageng Tirtayasa memiliki fasilitas laboratorium yang mendukung kegiatan pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat yang tersebar di dua lokasi kampus, yaitu Kampus Pakupatan dan Kampus Sindangsari. Di Kampus Sindangsari, terdapat dua laboratorium utama, yaitu Laboratorium Mikrobiologi dan Keamanan Pangan serta Laboratorium Teknologi Industri Pangan. Laboratorium Mikrobiologi dan Keamanan Pangan difokuskan pada kajian mikroorganisme dalam pangan, meliputi analisis kualitas mikrobiologis, keamanan pangan, serta pengujian kontaminasi yang berpotensi membahayakan kesehatan konsumen. Sementara itu, Laboratorium Teknologi Industri Pangan mendukung kegiatan pengolahan pangan skala pilot hingga industri, termasuk pengembangan produk, optimasi proses, serta penerapan teknologi dalam meningkatkan nilai tambah bahan pangan.
Di Kampus Pakupatan, terdapat Laboratorium Analisis Pangan dan Laboratorium Rekayasa Pengolahan Pangan. Laboratorium Analisis Pangan berperan dalam pengujian karakteristik kimia, fisik, dan sensori bahan pangan, yang menjadi dasar dalam penjaminan mutu dan standarisasi produk. Adapun Laboratorium Rekayasa Pengolahan Pangan berfokus pada penerapan prinsip-prinsip teknik dalam proses pengolahan, seperti perancangan alat, efisiensi proses, serta inovasi teknologi untuk menghasilkan produk pangan yang berkualitas dan berkelanjutan. Keberadaan keempat laboratorium ini menjadi pilar penting dalam mendukung pembelajaran berbasis praktik, riset inovatif, serta pengembangan kompetensi mahasiswa di bidang teknologi pangan yang terintegrasi dari hulu hingga hilir.